• 細胞動態實驗室

    從了解生命律動到疾病治療

  • 訊息

    思想,慶祝,回憶。

    January 1, 2019
    賀!皓坤榮獲108年度大專學生研究計畫研究創作獎! --- 2020/10/01 新 “Cryolysis and Gel Filtration”二人組~ 感謝Aka情義相挺!!!我...
    January 19, 2020
    LCD retreat The most rewarding part of being a scientist is to be able to ponder, to interact...
    August 2, 2018
    我念、我思、我夢想。    Thinking for Oneself. --- Arthur Schopenhauer Reading is thinking with some...
    June 2, 2018
    生日快樂~ 願大家運動健康,日日好食! 2021/02/22 2021 年初聚 能與一群志同道合的科學家,做夢、築夢、與實踐,真是人生一大樂事~ 未來一年我們一起努力吧!2021...
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  • 研究

     

    細胞如何藉由在空間和時間上接收到的外來訊息,來決定它們的下一步,例如生長、死亡或分化呢?我們使用系統生物學與合成生物學研究法,來探尋癌症與神經細胞行為決定的重要密碼與其調節原理(如振盪器、開關和觸發波)。本實驗室尤其著重在量化研究法的開發與應用,例如:單細胞動態顯微攝影、蛋白質與代謝體整合、以及動態系統數值模擬。我們的終極目標是希望能夠獲得對細胞行為決定的系統性理解,以便預測和控制細胞行為,從而更好地設計針對人類疾病(如癌症和神經退行性疾​​病)的治療策略。

     

     

     

     

    細胞也會思考嗎?

    單細胞系統生物學

    細胞行為的調控是一個基礎而未解的謎。我們提出一個假說,認為細胞內某些訊息分子的動態,代表了細胞的『思考』。如果能解構他們的思考過程,我們就有機會預測並控制細胞的行為。為了驗證這個假說,我們使用顯微鏡,長時間地觀察單一細胞的行為,以及細胞內訊息分子隨時間改變的動態。我們想知道知道細胞在想什麼,並希望能進一步控制它們的行為決定。(點這看人類RPE細胞的生長行為)。

     

     

     

    訊息分子是如何跳著舞呢?

    訊息分子的動態變化

    訊息分子在細胞裡,呈現在時間與空間上的動態(點這看p53在伽馬射線照射後,單細胞裡的震盪)。這些動態是如何藉由訊息分子間的互動而湧現呢?這些動態又有哪些功能呢?我們想藉由解構訊息動態在分子層次的調控邏輯,來瞭解這些訊息分子動態是如何演化生成的。

     

     

     

    癌症細胞如何面對飢餓?

    癌症代謝療法

    癌症細胞在代謝上,與一般的細胞不同。這使得它們對一些代謝刺激較於敏感,譬如說在某些氨基酸或是生長因子缺乏的情況下,癌症細胞特別容易死亡。我們想要探究癌症細胞對各種飢餓狀態的反應。進一步,想要瞭解飢餓對人體免疫系統對抗癌症細胞的影響。點這看自然殺手細胞如何殺死乳癌細胞。

     

     

     

    如何設計個人化的癌症療法?

    系統藥物動態學

    細胞是動態的系統。在給予癌細胞抗癌藥物之後,它們會隨著時間改變狀態。我們想要知道如何利用對癌細胞動態的掌握,來設計個人化的癌症最佳療法。因此,我們想(一)瞭解複合式標靶藥物的最佳化,(二)系統性的篩檢在時間與順序上,合適的藥物結合,(三)結合基因體、蛋白質體與代謝體的資訊,來尋找新的藥物標的。點這看兩個p53活化藥物隨著時間與劑量改變的複合藥效。

     

     

  • 實驗室成員

    陳昇宏

    科學家兼實驗室主持人 shengchen@gate.sinica.edu.tw

    我是個好奇的人,幸運地成為了科學家。

     

    希望在這裡,

    培養出

    有想法、有實踐力的科學家,

    一起做一些有趣而重要的研究。

     

     

    謝鳳書

    科學戰將 (癌症/表觀遺傳) fengshu0430@gmail.com

    雖然大部分時候結果都不是如自己所預測,

    一直到現在還是會為了實驗結果,

    驗證了自己的假說而開心不已!
     

    最想做的事情,是做有意義的研究,說一個好故事,

    期許自己的發現在不遠的未來能幫助別人。

    吳嘉洲

    科學戰將 (生物/電機) ccwu19@gate.sinica.edu.tw

    平凡的出身,有一點不那麼平凡的求學過程,再加上很多人的大力支持,

    跟些微的運氣,造就現在的我。

     

    目前有興趣的是將理論應用到生物系統上,也想要知道這個方法的極限在哪裡。

     

    許美安

    科學戰士(生物/免疫)annmikaela.co@gmail.com

    臺灣國際博士學程 分生與細胞

    Mika was born and raised in Manila, Philippines. She recently graduated from the University of the Philippines with a Bachelor’s degree in Molecular Biology and Biotechnology. She is immensely interested in the workings of the immune system, and for her undergraduate research, she studied the T cell response against a candidate vaccine antigen against malaria. Currently, she is looking into how key players in the immune response, metabolism, and DNA damage response interact upon exposure of normal and cancer cells to genotoxic compounds.

     

    林皓坤

    大學部科學尖兵 -(醫學/資訊)b04401068@ntu.edu.tw

    科技部大專生計畫

     
    《莊子》:「吾生也有涯,而知也無涯。以有涯隨無涯,殆已。」
     
    應是樂也而非殆已!
     

     

    許碧領

    科學戰士 -(生化)hannahkatrinaco@gmail.com

    臺灣國際博士學程 分生與細胞

     
    我夢想著一個世界,


    每個人都可以獲得知識,靈感和生活中美好的事物。

     

     

    鄭人豪

    科學戰士 -(生物/生資chengjenhao@gate.sinica.edu.tw

    臺大/中研院 基因體與系統生物學學位學程

    從小居住各地體會到世界處處透著不同,學習生物後更發現大自然裡無奇不有。喜歡深入分析、過度解讀週遭一切事物,更喜歡將五四三的科學知識ㄧ股腦地用到日常生活中,也期許自己能更紮實地運用這份興趣做出有趣的研究。

     

     

    李沂蓁

    科學戰士 -(醫/癌症)vivi50622@gmail.com

     

     
    一個微小的發現,卻賦予生命存在的意義。
     
    --- 這是成就我從事科學研究的最大動力。

     

     

    阮明維

    科學戰士 -(生物/系統生物duy.nguyenpm98@gmail.com

     
     
    我相信事情的發生是有原因的。 由於這些原因而進行的探索,讓我對科學如此地着迷。
    我希望通過我的發現幫助其他人,為世界的科學進步做出貢獻。

     

     

    Eclipse Ti LCD

    單細胞觀察家(光學/靈感)

     

    Elipse Ti LCD

     

    自日本出生,

    在台灣長大。

    張大眼睛,

    看生命!

  • 文章發表

    CEBU (Cell-specific Expression BUffering): Cell-specific gene expression can promote functional buffering for tissue homeostasis and cancer robustness.

    Multistability maintains redox homeostasis in human cells. Molecular Systems Biology, 2021 October 6;17:e10480

    Multistability: In-silico modeling of a nutrient-redox network and single-cell measurements of ROS demonstrate that ROS dynamics follow a bistable response to glucose deprivation in human cells.

     
    Biological oscillator: p53/Mdm2 acts as an autonomous oscillator that is suppressed by Mdmx in proliferating cells.

    Drug combinations: A review paper on the emerging trend of using the dynamics of biological systems for the rational design of combinatorial therapy. Specifically, we focus how to leverage three properties of signaling networks including 1. single-cell signaling dynamics; 2. signal adaptation and 3. crosstalk among signaling pathways for the rational design of drug combinations.

    Single-cell dynamics: We showed how single cell approach reveals unexpected p53 dynamics and how to use these dynamics to guide the design of time-dependent cancer therapy. This work was featured in Harvard Medical School News, Xinhua News, le monde fr and Wiezmann.

    Transcriptional dynamics: Here we identified the regulatory logic underlying a pulsatile transcriptional activity of glucocorticoid receptor (GR) using systematic and quantitative perturbations of the GR transcriptional system.

    Phospho-proteomics: Kinase-substrate network of the DNA damage checkpoint was mapped using quantitative phospho-proteomics.

    Enzyme kinetics: The DNA damage checkpoint signaling cascade was firstly reconstituted for identifying molecular mechanisms for checkpoint kinase activation.

  • 機會

    我們隨時歡迎對科學研究有興趣的年輕人,跟我們聯繫。請參考以下可能的工作機會。大部份的研究方向包含跨領域地實驗操作、電腦模擬或大數據分析,若是你/妳沒有相關經驗,但是肯學習,都歡迎你/妳跟我們聯繫。

    高中及大學生實習

    寒、暑假(暑假可參加分子生物研究所神經科學的暑期實習計畫或寒訓)或學期中(例如:科技部大專學生研究計畫與中研院大專生專題研究)都有研究實習的機會,並提供獎助金。歡迎對量化/系統/癌症生物學有興趣的高中及大學生,來信討論可能的研究主題與機會。

    研究助理

    我們正在招聘學士或碩士級助理。如欲申請,請將你/妳的研究經歷及履歷 (含 1-3 位推薦人姓名,不限於學校老師) 寄至 shengchen@gate.sinica.edu.tw。來信請加標題『細胞動態實驗室---助理申請』。

    碩/博士班研究生

    徵招對量化/系統/癌症生物學有熱情,對科學研究情有獨鍾的有志青年,加入我們。有興趣的志士,請參考臺灣國際學生學程分子與細胞神經科學奈米科技生物資訊博士班以及與臺灣大學合作的基因體與系統生物學碩/博士班學程。

    博士後研究員

    我們正在招聘博士後研究員。如欲申請,請將你/妳的研究經歷,研究興趣及履歷 (含 2-3 位推薦人姓名) 寄至 shengchen@gate.sinica.edu.tw。來信請加標題『細胞動態實驗室---博士後研究員申請』。

    • 生命、醫學科學相關研究所畢業,對 metabolism/cell biology/cancer biology/immunology 領域有所建樹,並對單細胞量化研究有興趣。
    • 物理/資訊/工程相關研究所畢業,對 cancer genomics/dynamic systems/systems biology/imaging analysis 領域有所建樹,並對單細胞系統生物學有興趣。

    中央研究院 博士後獎學金: http://daais.sinica.edu.tw/english/pro_pfp.php

     

  • 啟發

     

     

    “I do not know what I may appear to the world, but to myself I seem to
    have been only like a boy playing on the seashore, and diverting
    myself in now and then finding a smoother pebble or a prettier
    shell than ordinary, whilst the great ocean of truth lay all
    undiscovered before me.” --- Isaac Newton, 1642-1727

     

     

     

     

     

    Richard Feynman ? | Peter Walter ? | Martin A. Schwartz ? | Galit Lahav ? |

    | Uri Alon ? | Bruce Albert ? | Ken Robinson ? | Keith Yamamoto ? | Enrique M. De La Cruz ?

     

     

     

     

  • 老骨頭

    鍾智堯, 2016-2017 科學戰士 (獸醫/醫工), chihyaochung@gmail.com
    現職:英國倫敦大學博士生
    Jeffrey Shu, 2017 LCD 暑期研究生 (細胞與分子生物學),
    jeffrey.l.shu@gmail.com
    現職:MD student at Cleveland Clinic Lerner College of Medicine
    張靖, 2017/2018 LCD 暑期研究生 (醫學), u104001428@cmu.edu.tw
    現職:中國醫藥大學大學生
    Zhibek Keneskhanova, 2017 LCD 暑期研究生 (生物), zkeneskhanova@nu.edu.kz
    現職:Master Student at Kazakhstan
    侯萱吾, 2017-2018 科學戰士 (生物/生化), p230137@outlook.com
    現職:德國博士生
    Gaurav Agarwal, 2018 LCD 暑期研究生 (化學工程), agarwalgaurav.iitkgp@gmail.com
    現職:Indian Institute of Technology, Kharagpur 大學生
    李承學, 2018 LCD 暑期研究生, (生物/工程), 930leo@gmail.com
    現職:成功大學碩班生
    林皓坤, 2018 LCD 暑期研究生, (醫學), b04401068@ntu.edu.tw
    現職:臺灣大學大學生
    Jose Sandino Bandonil, 2018 科學戰士, (免疫/生物), jsbandonil@gmail.com
    Current: 中央研究院分子生物研究所助理
    黃若晞, 2018-2019 科學戰士, (動態系統/生物), johsihuang1@gmail.com
    Current: 史丹佛大學化學與系統生物學博士生
    鄧凱莉, 2018-2020 科學戰士, (分子與細胞生物) carolyn.a.dunlap@gmail.com
    Current: Research Scientist at ChemoCentryx

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